（1）来料加工是对方来料，我方按其规定的花色品种、数量进行加工，我方向对方收取约定的加工费用；进料加工是我方自营的业务，自行进料，自定品种花色，自行加工，自负盈亏。
（2）进料加工，进是一笔买卖，加工再出口又是一笔买卖，在进出口的合同上没有联系；来料加工原料进口和成品出口往往是一笔买卖，或是两笔相关的买卖，原料的供应往往是成品承受人
（3）来料加工的双方，一般是委托加工关系，部分来料加工，虽然包括我方的一部分原料，在不同程度上存在买卖关系，但一般我方为了保证产品的及时出口，都订有对方承购这些产品的协议，进料加工再出口，从贸易对象来讲，没有必然的联系，进归进，出归出，我方和对方都是商品买卖关系，不是加工关系。
对于来料加工和进料加工可以这样理解：来料加工视同销售免税货物，所以耗用的境内购进的材料负担的增值税进项税额是不能抵扣的。进料加工视同销售自产货物，出口适用零税率，可以抵扣购进材料负担的增值税进项税额。
