矩阵制组织结构的优点：
第一，由于项目经理与项目的关系更紧密，因而能更直接地参与到与其产品相关的战略中来，从而激发其成功的动力。第二，能更加有效地优先考虑关键项目，加强对产品和市场的关注，从而避免职能型结构对产品和市场的关注不足。第三，与产品主管和职能主管之间的联系更加直接，从而能够做出更有质量的决策。第四，实现了各个部门之间的协作以及各项技能和专门技术的相互交融。第五，双重权力使得企业具有多重定位，这样职能专家就不会只关注自身的业务范围。
但是，这种结构也存在缺点：
第一，可能导致权力划分不清晰（比如谁来负责预算），并在职能工作和项目工作之间产生冲突。第二，双重权力容易使管理者之间产生冲突。如果采用混合型结构，非常重要的一点就是确保上级的权力不相互重叠，并清晰地划分权力范围。下属必须知道其工作的各个方面应对哪个上级负责。第三，管理层可能难以接受混合型结构，并且管理者可能会觉得另一名管理者将争夺其权力，从而产生危机感。第四，协调所有的产品和职能会增加时间成本和财务成本，从而导致制订决策的时间过长。
