《个体工商户个人所得税计税办法》（国家税务总局令第35号）第二十七条规定，个体工商户向当地工会组织拨缴的工会经费、实际发生的职工福利费支出、职工教育经费支出分别在工资、薪金总额的2%、14%、2.5%的标准内据实扣除。工资、薪金总额，指允许在当期税前扣除的工资、薪金支出数额。职工教育经费的实际发生数额超出规定比例当期不能扣除的数额，准予在以后纳税年度结转扣除。个体工商户业主本人向当地工会组织缴纳的工会经费、实际发生的职工福利费支出、职工教育经费支出，以当地（地级市）上年度社会平均工资的3倍为计算基数，在本条第一款规定比例内据实扣除。第二十一条规定，个体工商户业主的工资、薪金支出不得税前扣除。

　　根据上述规定，个体工商户发生的“三费”在税前扣除时，应先按职工身份确定计费基数，即业主发生的以当地（地级市）上年度社会平均工资的3倍为计算基数，一般职工发生的以一般职工发生的工资、薪金总额为计算基数，再按相关比例在标准内据实扣除。