一、列入异常增值税扣税凭证的增值税专用发票
1、直接判定为异常增值税凭证的专票
符合下列情形之一的专票，列入异常凭证范围：
（1）纳税人丢失、被盗税控专用设备中未开具或已开具未上传的专票；
（2）非正常户纳税人未向税务机关申报或未按规定缴纳税款的专票；
（3）增值税发票管理系统稽核比对发现“比对不符”、“缺联”、“作废”的专票；
（4）经税务总局、省税务局大数据分析发现，纳税人开具的专票存在涉嫌虚开、未按规定缴纳消费税等情形的；
（5）走逃（失联）企业存续经营期间发生下列情形之一的，所对应属期开具的专票列入：
①商贸企业购进、销售货物名称严重背离的；生产企业无实际生产加工能力且无委托加工，或生产能耗与销售情况严重不符，或购进货物并不能直接生产其销售的货物且无委托加工的。
②直接走逃失踪不纳税申报，或虽然申报但通过填列增值税纳税申报表相关栏次，规避税务机关审核比对，进行虚假申报的。
2、申报抵扣了异常增值税扣税凭证后对应开具的专票
一般纳税人申报抵扣异常凭证，同时符合下列情形的，其对应开具的专票列入异常凭证范围：
（1）异常凭证进项税额累计占同期全部专票进项税额70%（含）以上的；
（2）异常凭证进项税额累计超过5万元的。纳税人尚未申报抵扣、尚未申报出口退税或已作进项税额转出的异常凭证，其涉及的进项税额不计入异常凭证进项税额的计算。
二、取得异常增值税扣除凭证的处理
1、纳税信用A级以外的纳税人
抵扣进项税额的 | 尚未申报抵扣增值税进项税额的 | 暂不允许抵扣 |
已经申报抵扣增值税进项税额的 | 除另有规定外，一律作进项税额转出处理 | |
出口退税 | 尚未申报出口退税或者已申报但尚未办理出口退税的 | 除另有规定外，暂不允许办理出口退税 |
适用增值税免抵退税办法的纳税人已经办理出口退税的 | 应根据列入异常凭证范围的专票上注明的增值税额作进项税额转出处理 | |
适用增值税免退税办法的 | 对列入异常凭证范围的专票对应的已退税款追回 | |
已经办理出口退税的纳税人因骗取出口退税停止出口退（免）税期间取得的专票列入异常凭证范围的，暂不抵扣或作进项税额转出处理 | ||
消费税纳税人以外购或委托加工收回的已税消费品为原料连续生产应税消费品，尚未申报扣除原料已纳消费税税款的，暂不允许抵扣；已经申报抵扣的，冲减当期允许抵扣的消费税税款，当期不足冲减的应当补缴税款。
2、纳税信用A级的纳税人
纳税信用A级纳税人取得异常凭证且已经申报抵扣增值税、办理出口退税或抵扣消费税的，可以自接到税务机关通知之日起10个工作日内，向主管税务机关提出核实申请。
经税务机关核实，符合现行增值税进项税额抵扣、出口退税或消费税抵扣相关规定的，可不作进项税额转出、追回已退税款、冲减当期允许抵扣的消费税税款等处理。
纳税人逾期未提出核实申请的，应于期满后参照上述纳税信用等级A级以外的纳税人规定作相关处理。